Les doubles diplômes délocalisés permettent d'harmoniser le niveau des diplômes entre les universités françaises et équatoriennes. La spécificité de ces formations est qu'elles sont dispensées par les deux établissements qui se partagent le cursus :

- Licence d’Epidémiologie des maladies tropicales entre l’Université Catholique de Guayaquil et l’Université de Bordeaux II.

- Licence en Sciences Economiques et Gestion délivrée par l’Université Jean Monnet de Saint-Etienne aux étudiants de la filière économique de la Faculté de Sciences de l’Ecole Polytechnique Nationale (EPN). Initiée en 2006, cette coopération débouche sur une vingtaine d’étudiants par promotion. Cette coopération s’étend désormais au niveau master 1.

- Licence en Sciences Economiques et Gestion délivrée par l’Université Pierre Mendès France (Grenoble II) aux étudiants de la filière économique de l’Université Pontificale Catholique de l’Equateur (PUCE). Initiée en 2009, cette coopération débouche sur une vingtaine d’étudiants par promotion. Les étudiants étudient trois ans à la PUCE et une année à distance avec Grenoble, avec des missions régulières de professeurs de Grenoble afin de réaliser des cours et encadrer les élèves. Les deux universités négocient actuellement un Master commun en politiques publiques

- Master en mathématiques entre l’Université Jean Monnet de St Etienne et l’Université Centrale de l’Equateur